神經內科是以專治腦血管疾病為主的綜合性科室。現設有神經內科重癥監護室及普通床位55張。擁有醫護人員27名，其中主任醫師1名（教授）、主治醫師3名、住院醫師6名、康復師1名、碩士研究生5名、護理人員16名。

      心血管內科是我院的重點專科之一，以診治心血管疾病為主要業務。有醫護人員30名，其中高級職稱5人，中級職稱4人，碩士研究生7人，科室開設病床55張，其中心臟病監護病房（CCU）設8張，配有獨立的專業護理單元及高、精、尖搶救設備。

      內分泌科是咸陽市最早開展的內分泌代謝疾病診斷和治療的特色專科之一，科室現開設床位36張，有醫護人員20名，其中高級職稱3名，中級職稱1名，護師（士）12名。

      消化內科是我院的重點專科之一，現分設消化內科病區和消化內鏡中心兩個部門，病區開設床位36張，現有醫護人員28名，其中主任醫師1名（教授）、副主任醫師2名（副教授）、高年資主治醫師3名、碩士研究生5名、護師（士）14名。

      血液腎病科是我院以治療血液疾病、腎臟疾病和老年病為主的重點專科，現有醫護工作人員24人，其中副主任醫師以上4人，研究生5人，設置床位40張。

      呼吸內科是我院以治療呼吸系統疾病為主的重點專科，科室醫療設備齊全，技術力量雄厚。設有病床31張，現有醫護人員20余人，其中有主任醫師1名（教授），副主任醫師1名（副教授），主治醫師4名，住院醫師2名。

      普外科是我院特色專科之一，是以手術治療外科疾病為主的綜合性科室，設置床位40張，其中，重癥監護病房床位4張、搶救治療床2張。擁有醫師9名、研究生5名。其中主任醫師（教授）1名，副主任醫師（副教授）2名，主治醫師3名，住院醫師3名。

      骨一科是我院以創傷骨科、微創化骨科為主的重點專科，業務涵蓋創傷、脊柱、關節、矯形、手足外科等。該科開設病床40張，現有醫護人員22人，高級職稱3人，中級職稱4人，研究生7人。

      骨二科是我院重點專科之一,現開設床位40張,擁有醫護人員22人,其中高級職稱2人,中級職稱3人。

      骨三科是我院重點學科之一，目前開放床位33張，現有醫護人員20人，其中高級職稱2人，主治醫生4人，住院醫師2人，碩士以上研究生2人。

      肝膽外一科是陜西省優勢醫療專科，是我院重點學科。現開設床位40張，有醫護人員20人，其中主任醫師2人，副主任醫師2人，主治醫師2人，住院醫師3人，博士研究生1人，碩士研究生2人。

      肝膽外二科是我院新成立的特色科室，是以手術為主要方法治療肝臟、膽道、胰腺、胃腸、肛腸、血管疾病、甲狀腺和乳房的腫瘤及外傷等疾病的臨床學科。

      神經外一科是咸陽市重點專科，以微創、顯微技術為特色，以神經系統腫瘤、腦血管病和脊柱脊髓神經外科為專業方向，承擔著咸陽市顱腦創傷病人的救治任務。

      神經外二科是咸陽市重點專科，現開設床位40張，科室技術力量雄厚，有醫護人員20人。主任醫師1名，副主任醫師3人，主治醫師2人，住院醫師2人，護理人員13人，其中研究生5名，2人為咸陽市優秀青年科技人才，咸陽市“三五”人才。

      泌尿外科（外五科）是我院以治療泌尿系腫瘤、結石、前列腺、膀胱、腎上腺疾病、男科性功能障礙、不育不孕癥為主要業務特色專科之一，科室現有體外碎石專業組、血液透析專業組、專科門診和病區四個小組。

      心胸腫瘤外科是咸陽市率先開展心臟直視手術的科室，是“咸陽市胸心外科研究室”、“西京醫院心臟外科咸陽市協作中心” ，已完成各種心臟病手術400余例，可進行各種先天性心臟病及心臟瓣膜病手術。